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[桂花树价格]桂花变异转座子系统的应用与展望

2019-09-16 06:34:04

  通过转座子标记方法是近年来的非常有效的分子生物学技术的发展,它涉及通过在高等植物的基因组中插入TE引起基因突变插入的突变基因,然后分离插入在相邻的序列由TE。策略在高等植物的功能基因组学研究中非常有用。花换位子系统主要包括三类:En / Spm系统,Ac / Ds系统和Mutator系统。座子赋值函数很容易在基因和基因周围插入,造成10-5正突变频率10-4,比野生桂花高约30倍,大多数突变所引起隐性突变。

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  以通过TAIL-PCR方法克隆由转座子突变体引起的突变。前,已经通过该方法克隆了一些重要的基因。文主要介绍了Transposon Mutator的应用以及Mutator转座子系统的搜索前景。内,麦克林托克发现在桂花,其随后被称为转座或transposon.En化学元素的控制元件,转座子是基因组DNA序列[1] 。后,还发现了细菌,酵母和动物以及高等植物中的转座因子。因组中的转座子可以从其原位点复制或片段化,并通过环化插入其他位点[2]。座子的发现大大推动了分子生物学的发展。解转座子的结构有助于分析生物进化的具体机制,是生物学研究的一种更实用的工具。包括三种类型的转座子系统,即系统恩/ SPM [3],CA系统/ Ds的[4]和增变系统(M)[5],包括穆换位子系统是最高的[突变能力] [6]。

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  Mu转座子可以插入基因内部和周围,导致隐性突变[7]。以通过TAIL-PCR克隆相应的突变基因。1984年,使用转座子标记方法分离了青铜桂花基因,从而增加了克隆基因的数量。因组中的Mu转座子通常具有更多拷贝,并且所得突变通常发生在非连锁区域中,导致表型突变。于Mu转座子的独特性和用途,它已成为分子生物学研究的重点[8]。

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  反向遗传学研究中,Mu转座子发挥了重要作用[9]。
  三种主要粮食作物(桂花,水稻,小麦)中,桂花的年产量最高,现在是世界上最大的作物[10]。不仅是重要的食品和饲料作物,也是食品工业的重要原料和能源来源[11]。人的桂花生产在维护全球粮食安全和全球经济稳定发展方面发挥着重要作用[12]。子生物学技术的快速发展,有利于桂花和功能基因组学研究桂花的基因组序列的测序和遗传资源桂花设备和研究的创建分子选择。基因功能的研究,该突变体是直接的材料和最有效的[13],并在创建库桂花突变体中,转座子系统穆起着重要的作用。Mu转座子家族由两个主要类别组成,即自主MuDR因子和非自主因子。决于刀片穆的内部序列的特异性,穆插入件可分为6亚家族,即MU1 / MU2,MU3,MU4,染mu6 / MU7,MU8,MUDR / MU5 [6] 。中,先前命名的MuA2,MuR1,Mu9和Cy分类在亚家族MuDR中,其可以编码转座所必需的蛋白质;非自主因素主要因素MU1 / MU2,MU3,MU4,染mu6 / MU7和MU8,这一因素不能自主转置,桂花树价格桂花树价格并且当MUDR一起存在换位可以发生。于存在自主因素,非自主因素变得不稳定。2002年的随访研究,查尔斯和他的合作者发现穆三个因素,即MU10,MU11和Mu12 [14],而在2011年,陈和他的同事发现,在Mu13转座元件UniformMu桂花家族[8]。是一种转座活性成分。Mu转座子的转座频率非常高[15],可能发生在体细胞和生殖细胞中。果切除和转座子插入发生在体细胞中,可发生突变以现代方式,受回复突变和非继承,并且如果在前减数分裂细胞和配子发生换位,所述发生突变的频率。对较弱,通常是继承的。此,当评估Mu转座子的活性时,通常通过家族杂交育种和近交系杂交后发生的突变数量来测量。统计学中,统计数据对于质量性状的突变更准确,环境因素对数量性状突变的影响更大,使得统计结果不太可靠[16]。管Mu可能在任何菌株的基因组中引起插入突变,但不同的遗传背景可能会影响Mu转座,并且突变频率可能从一个基因到另一个基因的差异超过8倍[17]。]。Mu转座子插入在基因组中具有一些偏好,并且可以插入启动子,5非转录区,外显子和内含子中。Mu转座子插入的靶位点序列是转座酶识别和错误的特定序列[18]。常情况下,Mu转座子的插入是5末端附近转录起始位点的最强选择[18]。扩增已知序列的侧翼序列时,通常使用交错的热交错PCR(TAIL-PCR)方法。TAIL-PCR方法是一种用于染色体步移,其被首先应用到粘粒载体(P1)的分离的技术和酵母人工染色体插入之后的序列,然后用于该序列的测定转座子插入位点的侧翼。TAIL-PCR,使用三个嵌套的特异性引物,分别用简并引物相关联,允许PCR的连续循环,采用不同的退火温度,以选择性地扩增靶片段和得到放大的片段。以直接用作测序模板或探针标记。

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  实验过程中,根据已知的DNA序列设计了三个特异性引物(SP),SP必须在同一方向,退火温度较高。具有较低退火温度的简并引物组合(可设计几个条带,AP1,AP2,AP3,......)进行热不对称PCR反应。常,至少一种简并引物可用于使用退火温度差与特定引物进行热不对称PCR反应。三次巢式PCR反应后,获得已知的侧翼序列序列。测试中获得的扩增产物的长度,是否测试要求得不到满足,可以基于在第一步骤中获得的序列信息,然后是侧翼序列[19]的扩增。据转座子Mu的TIR序列,Settles等。[20]设计了一种特定的嵌套引物:优化PCR-TAIL-PCR MuTAIL已经提出了一种方法,该方法可以被用于插入穆因子的靶位点的侧翼序列英寸均匀放大。MuTAIL-PCR方法简单,程序小,实际应用。方法的示意图[21]是图1刘瘟挺等所示[21]中使用的优化的技术MuTAIL-PCR扩增的105生物信息学分析的序列,其中99为Mu转座子的侧翼序列和阳性率达到94.2%。MuTAIL-PCR技术可有效扩增Mu转座子插入位点的侧翼序列。座子沐具有较高的正突变率和插入丰富的基因和低拷贝序列区的区域,这表明了沐以来座子在功能基因组学研究中的发现桂花。用最广泛[22]。入功能基因附近或内部的因子可能改变基因的功能,导致可见表型的突变。相对较小的群体中,Mu转座子可以诱导覆盖整个基因组的大量突变体。

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  于Mu转座子具有相对保守的TIR,因此可以在TIR的基础上设计PCR引物,以有效地检测由Mu转座子诱导的突变插入群体[23]。以将Mu转座子插入基因的任何区域,包括启动子,内含子,外显子等。于Mu转座子的这些特征,它有效地用于创建桂花突变体文库并实现突变基因的分离。Mu转座子成功地创造了桂花突变体库[24]。于构建桂花突变体文库的方法包括物理,化学,农杆菌介导的T-DNA插入突变和转座子[25]。具有高频率的诱变,对插入位点的低偏好和基因组中的多个拷贝。于获得的突变体转座子诱导的突变体Mu,进行Mu转座子插入位点的侧翼序列的生物信息学分析以预测突变体基因的功能。前有多种方法可以将Mu转座子插入到侧翼序列中[26]。PCR行走技术,反向PCR技术[27],TAIL-PCR技术,AFLP技术[28]等是常用的。些研究人员使用Mu的转座子系统成功构建了一个桂花突变体文库[29]。1995年,美国先锋公司首次应用Mu转座子成功构建桂花角色效用系统(TUSC),并消除了由Mu转座子引起的数百次插入。变体。May及其同事[30]公开收集了40,000个含有Mu转座子的桂花家族,并建立了桂花特异性诱变数据库(MTMdB)。Fernandes等人[17]所使用的RescueMu遗传修饰以将其传送到线樨,然后与穆菌株换位到转置穆因子,并已取得了RescueMu序列数据库。含有Mu转座子的W22(UniformMu)回交群体中,McCarty及其同事[31]通过微阵列方法检测了2000多个突变体谷粒系。国家研究,与活性穆转座子的材料被引入作为供体,并与本地精英混合线路樨的接收器,和一个大的人口由得到插入M1诱变杂交。21]亩转座子转座频率用在该领域和字符的内部插入,且目标部位的侧面的评价突变的鉴定评估扩增,克隆,测序和在bioinformatiquement分析使用优化的MuTAIL-PCR技术[20]。列,构建由中国转座子介导的第一个木楠插入突变体文库。过使用土壤杆菌介导的桂花转化的土壤杆菌介导的桂花转基因技术系统的转化获得转基因植物和后代。朵种子的平均附着率为39%,受精卵的转化频率大于1%,转化的基因可以遗传[32]。座子染色方法是由于将转座子插入基因而筛选突变表型的方法。子生物学技术被用于识别包含转座子和突变基因的部分序列被施加到与分子杂交制备探针的突变基因,并且该基因的剩余片段从基因组文库中筛选。
  行完整的序列确定。获得的基因的完整序列,在一方面,为了获得基因的结构和可能的理论生物学功能,而另一方面,所述载体的构建和序列的遗传转化的序列的生物信息学分析确定基因的真实生物学。能。多基因已被Mut突变体库成功分离和克隆[17]。使用银行穆突变体筛选突变体香桂花突变体,创建一个新的桂花种质资源步伐加快和理解的合成发展的研究桂花中的胚乳和淀粉受到青睐[33]。Chen Guo等[34]利用Mu转座子鉴定了5种桂花蛋白磷酸酶基因对水分胁迫的响应;最近的一项研究有效地鉴定了桂花中ZmCIPK23基因的Mu插入突变体[35]。研究穆转座子,发现转座元件自主MUDR有很大的意义和对MUDR因素包括高频率变换机制转了一系列系统的研究Mu,将来会进行。MuDR的表观遗传机制。Mu转座子可以进行较低的体细胞插入,共抑制和逆转突变,这增加了Mu转座子系统研究的复杂性。进行这项研究,就必须具有创造性。究Mu因子与其宿主在进化过程中的关系也是非常重要的。用转基因方法直接将Mu因子引入异源植物是一个困难但重要的主题:如果可以转化活性Mu因子,它可以用作其他异源物种的有效工具。传诱变,构建Mu转座子插入突变异源物种文库和基因分离研究。制Muk转座活性的位点促进MuDR沉默的机制,特别是在基因的转录水平,需要进一步研究。有这些研究结果肯定会有利于分子生物学的发展[36]。前,已成功构建了拟南芥和水稻的基因组示意图,并完成了桂花基因组测序[37]。对植物基因组序列的大量信息,揭示每个基因的特定功能非常重要[38]。了充分利用Mu因子和高拷贝数,Mu因子标记方法可以在寻找分离的克隆植物基因中发挥更有效的作用。目前为止,穆转座子被发现有活性最高,转让,转座子最强大的植物mutagène.Bien监管机制的换位仍是未知数,插入诱变桂花的进行。分离的克隆基因中,Mu转座子已成为一种重要的研究方法。
  着分子生物学的迅速发展和对Mu转座子特征和机制的深入研究,Mu因子系统必将在功能基因组学研究中发挥更加重要的作用。
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