通过RT-PCR扩增获得绿色黄瓜花叶病毒(CGMMV)山东泰安南瓜分离株(CGMMV-TANG)包膜蛋白基因。过序列分析,分离出包膜蛋白(CP)。基因的长度为486个核苷酸,由161个氨基酸组成。较CP基因的核苷酸序列的同源性,并构建系统发育树。过结合宿主和地理来源进行分析,结果表明不同的病毒分离株与地理区域具有一定的关系。花绿斑花叶病毒(CGMMV)是Tobamouirus属的成员,最早由Ainsworth报道。

主要分布在欧洲和亚洲国家和地区,例如日本,印度和英国,并且是许多国家和地区的重要隔离病毒之一,严重威胁诸如西瓜,甜瓜和桂花等葫芦的生产,通常使产量减少约15%。年来,在中国不同地区发现了这种病,这是一种潜在的危险害虫。厦门检验检疫局于2004年首次拦截进口的日本木瓜种子的CGMMV以来,已在河北,甘肃,北京,辽宁等地区相继发生。

2005年,辽宁省盖州市仅CMVMV感染的西瓜面积仅为333 hm2。中,必须收获13hm2。此,农业部发布了第788号公告,将其确定为农业植物检疫的国家机构。此,加强知识,发现和对抗病毒流行特别重要。研究采用RT-PCR方法检测山东泰安南瓜样品中的CGM-MV病毒,并比较了其包膜蛋白(CP)基因的序列,分析。山东泰安田收集了感染了CMGMV的南瓜病菌株。Transzol,M-MLV,RNase抑制剂和TaqE由北京全世进公司提供; pMD18-T克隆载体和核酸内切酶购自TaKaRa公司。Transzol方法用于直接从患病叶片中提取总RNA作为模板,并使用来自CGMMV的G1-3:5-TGGGC-CCCTACCCGGGAAAAAG-3引物进行逆转录。5末端引物C1-5:5-ATGGCTrACAATCCGATCAC-3和配对的引物G1-3用于PCR扩增。使用的程序为:94℃3分钟; 94°C 55s,55°C 55s,72°C 1min,30个循环; 72 10°C回收PCR产物后,将其与pMD18-T连接,然后转化到大肠杆菌DH5a中,纯化质粒,并通过PCR和酶切鉴定。重组质粒发送至上海博雅股份有限公司。行测序。在GenBank中获得的序列进行BLAST搜索;使用DNAMAN和DNAstar等软件分析核苷酸和氨基酸序列,使用MEGA4.1构建系统发育树。
过琼脂糖凝胶电泳检测通过RT-PCR扩增的产物,获得约700bp的片段(图1)。序结果表明,南瓜上的分离物为CMGMV。增产物的序列分析表明,获得的目标片段的长度与预期结果一致,为667 bp,包含完整的CP基因,共486个核苷酸,编码161个氨基酸(图2)。以及其他CGMMV报道的分离株相同,命名为CGMMV-TANG(GenBank访问号:GQ500898)。苷酸同源性比较表明,与辽宁西瓜分离株(EF611826)的核苷酸同源性最高,达到99.6%,与西班牙桂花分离株的同源性最高。(GQ411361)最低,为91.6%。
GenBank上不同区域的不同宿主中共选择了21种CGMMV和CGMMV-TANG分离株。较这些分离物的CP基因的核苷酸序列的同源性,并且核苷酸序列彼此非常相似。均同源性是96.9%。


CGMMV-TANG与其他分离株的同源性为91.6%至99.6%,氨基酸的同源性为98.5%至100%。用AB162006(Kyuri Green斑驳病毒,KGMMV)作为外部组,对这21个分离株的CP基因核苷酸序列的系统树分析(图3)显示,KGMMV和CMGMV分离株是独立的de分支和CGMMV分离株可分为与进化I和II相关的两组。一组主要包括来自中国大陆,台湾,日本,韩国,法国和希腊的15种分离株,CMGMV-TANG位于第1组。过比较发现第一组分离株的同源性核苷酸序列同源性。源是从97.3%至99.6%,
桂花树价格第一组和第二组之间的同源性是从90.6%至92.6%。Ⅱ组包括来自希腊,西班牙和俄罗斯的6种欧洲分离株,同源性在95.7%和100%之间。花绿色花叶病毒是危害葫芦科植物的重要病毒之一,自2004年以来不断报道其危害。005年,广西农业科学院从桂花中分离出CGMMV。西农业展览中心的观赏南瓜叶;陈宏运等人于2006年在辽宁西瓜中检出CGM-MV。红霞等人于2007年在甘肃南瓜果实中检测到CGMMV。2009年; 2009年田永磊等人在北京甜瓜和山东西瓜中检测到CGMMV。这项研究中,该病毒首先是从山东田间的南瓜中分离出来的,并在核苷酸序列CP的水平上分析了不同菌株与宿主和区域来源之间的关系。该序列构建的系统进化树表明,CMGMV分离株可分为两类:第一组,法国分离株(AJ429090)和希腊分离株(AJ459423)为亚洲分离株,而第二组是欧洲分离株,表明不同CGMMV分离株的基因组变异具有一定的区域相关性,这与张永江等报道的结果不一致。(2008年),但不同菌株的基因组变异与宿主物种无关。系统发育树中可以看出,I和Ⅱ组可以分为三个不同的亚组。
CGMMV-TANG位于I亚组。列比对显示,同源性最高的分离株是中国辽宁(EF611826),为99.6%;其次是韩国分离株(AF417243)和日本分离株(D12505),占99.4%,表明日本和韩国报告的CGMMV-TANG和CGMMV具有共同的流行来源感染,进一步证实了中国的CGMMV可以从国外引入和传播。Ⅱ组三个亚群的分离株来自希腊,西班牙和俄罗斯等欧洲国家,这进一步解释了为什么它们在该地区具有一定的相关性。前,关于中国遗传CMGMV的起源和进化的研究很少,比较整个CMGMV基因组核苷酸序列的同源性可以更好地确定其遗传结构。CGMMV基因组因区域不同而发生了变化。
要其他研究。
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